本书内容分为6章，第1章介绍了本书成果的研究思路和学术思想。第2~5章详细介绍了复合菌系的构建方法、复合菌系的理化性质、复合菌系的培养条件优化、微生物组成多样性，以及初步解析了复合菌系分解纤维素的机理。第6章介绍了复合菌系在农业有机固体废弃物资源化中的应用，主要是在秸秆和畜禽粪便好氧堆肥化中的应用效果和作用机理；同时介绍了乳酸菌复合菌系和沼气复合菌系的构建方法、性质、微生物多样性分析和应用效果；最后对农业废弃物资源化利用的趋势提出了著者浅显的见解。